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賽默飛無氯仿提取RNA解決方案來了!

2024-04-01 09:21:30

TRIzol試劑

1977年,科學*** Axel Ullrich 和他的同事們提出使用異硫氰酸胍(Guanidine Thiocyanate)用于 RNA 的分離純化,至1990 年,優化該方法后,推出商業化的 TRIzol 試劑。

賽默飛TRIzol試劑是***種即用型試劑,用于在1小時內從人類、動物、植物、酵母或細菌來源的細胞和組織樣本中提取高質量的總RNA(以及DNA和蛋白質),TRIzol試劑在樣本勻漿化時,可以破壞細胞,溶解細胞組分,同時高效的抑制RNA酶的活性,從而維持RNA的完整性。

TRIzol無氯仿解決方案


由于在TRIzol試劑的提取過程中,需要使用氯仿,而氯仿具有揮發性,會對眼睛、呼吸道、皮膚和黏膜造成刺激,因此迫切需要***種無氯仿解決方案。經過賽默飛科學***的不懈探索,發現了1-溴-3-氯丙烷(1-Bromo-3-chloropropane ,BCP)可以替代氯仿,搭配TRIzol試劑提取RNA,接下來,小編就和大******睹為快——TRIzol無氯仿提取RNA的效果。

操作流程


在樣本進行勻漿化時,加入0.2mL氯仿或者0.1mL BCP,進行RNA提取。

圖1. 操作流程示意圖,詳細步驟如下:

  1. 加1mL TRIzol試劑,裂解樣本,室溫孵育5min。

  2. 加0.2 mL氯仿或 0.1 mL BCP,振蕩混勻,孵育3min。

  3. 在4°C下12000×g離心樣本15min。

  4. 取約500μL上清液至新樣本管中。

  5. 加等樣本體積的異丙醇,顛倒混勻,在4°C下孵育10min。

  6. 在4°C下12000×g離心10min,棄上清。

  7. 加1mL 75%乙醇,重懸沉淀,短暫渦旋樣本,在4°C下7500×g離心5min,棄上清液。此步驟重復***次。

  8. 干燥5-10min,加20-50μL RNase-Free水,在55°C的水浴孵育10min。

實驗結果


分別使用氯仿和BCP對5mg和20mg的兔的肝臟和腦組織,按照TRIzol試劑的說明書進行RNA提取,每組實驗設置3個重復,對得到的RNA產物進行含量、純度、完整性等進行評估。

RNA含量和純度



圖2. Nanodrop檢測RNA的產量和純度

RNA完整性測定


圖3. Agilent 2100測定RNA完整性和計算RIN指標

RT-qPCR分析


圖4. 對提取RNA進行RT-qPCR檢測內參基因:GAPDH和ACTA2,說明BCP提取的RNA,與氯仿相比,內參基因表達量無顯著差異。

圖5. 提取RNA進行Xeno抑制性實驗,說明,BCP和氯仿所提取出來的RNA不會擴增抑制后續的RT-qPCR實驗,降低假陰性結果的可能性,確保RT-qPCR檢測結果是準確和可控的,再次佐證了可以使用BCP搭配TRIzol試劑使用。

小結

在有機法提取RNA的過程中,賽默飛無氯仿提取后的RNA,含量高,純度好,完整性指數高,可直接做后續的RT-qPCR實驗。


(文章來源于儀器網)

(來源:


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