快速菌膜鑒定，真的可以嘗試嗎？
為了縮短鑒定時(shí)間，快速提供臨床可信賴的結(jié)果，在以“為所有膿毒癥患者提供48小時(shí)內(nèi)***低抑菌濃度藥敏結(jié)果”為目標(biāo)的膿毒癥全流程解決方案中，MALDI-TOF MS是實(shí)現(xiàn)快速鑒定分***報(bào)告的重要環(huán)節(jié)。針對陽性血培養(yǎng)進(jìn)行快速質(zhì)譜鑒定能夠進(jìn)***步免去隔夜傳代培養(yǎng)時(shí)間，從而加速報(bào)告。因此，陽性血培養(yǎng)的快速鑒定方法成為大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室關(guān)注的焦點(diǎn)。 2019年，歐洲臨床微生物學(xué)和傳染病學(xué)會（ESCMID）發(fā)起了***項(xiàng)基于微生物實(shí)驗(yàn)室血培養(yǎng)流程的現(xiàn)狀調(diào)研，其中37.3%（78/209）的實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行了血培養(yǎng)菌膜的快速鑒定。 本文分享了三篇應(yīng)用VITEK MS的研究，研究從固體培養(yǎng)基上挑選短時(shí)孵育（從常規(guī)的16-24小時(shí)孵育縮短到4-8小時(shí)）的菌膜進(jìn)行直接鑒定。相較于直接從陽性血培養(yǎng)物中提取鑒定細(xì)菌，這種方法操作更加方便，并且減少了肉湯培養(yǎng)基和血液對鑒定結(jié)果的干擾因素。
文獻(xiàn)*** VITEK MS短時(shí)孵育3h、5h的鑒定成功率[1] 意大利都靈大學(xué)醫(yī)學(xué)院共入組了162例單微生物血液培養(yǎng)物，其中121例為革蘭氏陰性菌株（占74.7%），32例為革蘭氏陽性菌株（占19.8%），以及9例酵母菌株（占5.6%）。研究發(fā)現(xiàn)，質(zhì)譜在種水平鑒定上的準(zhǔn)確性與傳統(tǒng)方法相比，在3小時(shí)、5小時(shí)和24小時(shí)的時(shí)間點(diǎn)分別達(dá)到60.5%、80.2%和93.8%的***致性。 對于革蘭氏陰性菌，腸桿菌科的鑒定率***高；對于革蘭氏陽性球菌，金黃色葡萄球菌的鑒定結(jié)果***好（鑒定成功率為***）。此外，研究發(fā)現(xiàn)，凝固酶陰性葡萄球菌（CoNS）在培養(yǎng)5小時(shí)后就獲得了良好的鑒定結(jié)果（鑒定成功率為88.2%），且沒有被誤認(rèn)為金黃色葡萄球菌，這無疑是快速區(qū)分真正的病原體及可能的污染的有效方法。 然而，在***篇關(guān)于某***際進(jìn)口品牌B評估的文章中，研究對435個(gè)單微生物培養(yǎng)物進(jìn)行了快速鑒定。結(jié)果顯示，在傳代短時(shí)孵育5小時(shí)后，金黃色葡萄球菌的鑒定成功率為79.5%，而凝固酶陰性葡萄球菌（CoNS）的鑒定成功率為53.8%[2]。 VITEK MS從建庫菌株的多樣性出發(fā)，同時(shí)考慮操作人員和培養(yǎng)條件的差異，采用權(quán)重矩陣算法構(gòu)建準(zhǔn)確數(shù)據(jù)庫。這是目前唯***能夠提供單***臨床診斷結(jié)果的平臺，無需在多個(gè)鑒定結(jié)果中進(jìn)行選擇，從而將報(bào)告結(jié)果錯(cuò)誤的風(fēng)險(xiǎn)降至***低。該平臺可以為臨床提供準(zhǔn)確且快速的二***鑒定報(bào)告。 文獻(xiàn)二 VITEK MS短時(shí)孵育6h、8h的鑒定成功率[3] 芝加哥大學(xué)醫(yī)學(xué)院共收集了134例血培養(yǎng)陽性樣本，這些樣本被直接轉(zhuǎn)種至預(yù)熱1小時(shí)的血平板，并在培養(yǎng)2、4、6、8、10小時(shí)后進(jìn)行評估，無需進(jìn)行乙醇-甲酸蛋白質(zhì)提取。研究發(fā)現(xiàn)，在培養(yǎng)4小時(shí)后，陰性菌的正確鑒定率達(dá)到94%；在培養(yǎng)6小時(shí)后，陽性菌的正確鑒定率達(dá)到98%。 總體上，培養(yǎng)6小時(shí)后的總鑒定成功率超過90%；培養(yǎng)8小時(shí)后，總鑒定成功率達(dá)到95%。 文獻(xiàn)三 VITEK MS PRIME 短時(shí)孵育3-4h菌膜鑒定成功率[4] VITEK MS PRIME是2024年新上市的質(zhì)譜系列產(chǎn)品，完全延續(xù)了VITEK? MS在數(shù)據(jù)庫和算法上的可靠性，同時(shí)改善了操作流程的體驗(yàn)感。實(shí)驗(yàn)室可隨時(shí)加載靶板并調(diào)整檢測優(yōu)先***，***多支持16張靶板同時(shí)在線，可在實(shí)驗(yàn)室任意電腦上進(jìn)行信息錄入及結(jié)果查看，將人在設(shè)備面前的等待時(shí)間降至零，優(yōu)化了鑒定流程。該系統(tǒng)更高效地實(shí)現(xiàn)了與LIS分***報(bào)告及VITEK 2藥敏流程的對接，從而節(jié)省人力、提升TAT（周轉(zhuǎn)時(shí)間），并支持臨床更早從經(jīng)驗(yàn)治療轉(zhuǎn)向目標(biāo)治療。 ***項(xiàng)納入218株菌的臨床實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)顯示，VITEK MS PRIME在3-4小時(shí)培養(yǎng)（菌膜）后的鑒定成功率高達(dá)70.2%，而某***際進(jìn)口品牌B的成功率為55.5%。 準(zhǔn)確且快速的二***鑒定報(bào)告的發(fā)出，必須基于***個(gè)穩(wěn)定且可靠的數(shù)據(jù)庫，并配合信息化的全流程溯源，才能真正助力微生物實(shí)驗(yàn)室在血流感染患者中的抗菌藥物治療。需要注意的是，在使用菌膜進(jìn)行二***報(bào)告鑒定前需進(jìn)行性能驗(yàn)證，對于無法通過此方法識別的微生物（例如，血培養(yǎng)混合感染樣本、革蘭氏陽性桿菌、厭氧菌及酵母菌等），仍需通過過夜培養(yǎng)以獲得成熟菌落進(jìn)行識別。 目前，***內(nèi)已有多***實(shí)驗(yàn)室實(shí)現(xiàn)了鑒定時(shí)間少于32小時(shí)的二***報(bào)告。中***科學(xué)技術(shù)大學(xué)附屬醫(yī)院評估并比較了使用VITEK MS進(jìn)行的快速微生物鑒定與常規(guī)微生物鑒定對血流感染住院患者抗生素使用、臨床結(jié)局和衛(wèi)生經(jīng)濟(jì)學(xué)的影響。研究顯示，引入VITEK MS后，從入院到***次目標(biāo)性抗生素治療的時(shí)間縮短了28.7小時(shí)（p<0.001），平均住院時(shí)間縮短了5.9天（p<0.001），平均節(jié)省抗生素費(fèi)用7300元（1021美元）（p<0.001），平均住院費(fèi)用節(jié)省24078元（3368美元）（p<0.001）。該研究內(nèi)容也發(fā)表在2024年ECCMID（Poster NO：P0874）。 參考文獻(xiàn)： [1] Curtoni A, Cipriani R, Marra ES, Barbui AM, Cavallo R, Costa C. Rapid Identification of Microorganisms from Positive Blood Culture by MALDI-TOF MS After Short-Term Incubation on Solid Medium. Curr Microbiol. 2017;74(1):97-102. [2] Pranada AB, Cordovana M, Meyer M, et al. Identification of micro-organism from positive blood cultures: comparison of three different short culturing methods to the Rapid Sepsityper workflow. J Med Microbiol. 2022;71(8):10.1099 [3] Bhatti MM, Boonlayangoor S, Beavis KG, Tesic V. Rapid identification of positive blood cultures by matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry using prewarmed agar plates. J Clin Microbiol. 2014;52(12):4334-4338. [4] Grohs P, Remaud E, Lath C, et al. Comparison of the New VITEK MS PRIME System with the Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization Biotyper Microflex LT for the Identification of Microorganisms. Ann Lab Med. 2023;43(6):574-584.
(文章來源于儀器網(wǎng))
